自2010年以来，实验室获得国家科技进步二等奖一项：“慢性阻塞性肺疾病发病与综合防治（2015）”、广东省科技进步一等奖两项:“慢性阻塞性肺疾病发病与人群防治研究(2014)”、“肺癌个体化微创根治相关技术的系统研究及临床应用推广(2015)”、教育部科技进步二等奖“临床重要耐药菌的发生和传播新机制及临床应用”一项（2014）。组织制定或修订了我国多项呼吸疾病诊治指南和规范，包括：肺功能检查指南系列(2014，2015)、慢性阻塞性肺疾病急性加重防治专家共识(2014)、慢性阻塞性肺疾病诊治指南(2013)、支气管哮喘防治指南(2013)、阻塞性睡眠呼吸暂停与卒中诊治专家共识(2014)、呼吸机相关性肺炎诊断、预防和治疗指南(2013)等。